学校现有11个二级学院和4个教学部：生物科学与工程学院、植物科学技术学院、动物科学技术学院、经济管理学院、园林学院、食品科学与工程学院、计算机与信息工程学院、文法学院、城乡发展学院（继续教育学院）、国际学院、思想政治理论教学科研部、基础教学部（外语教学部、体育教学部）。

        北京农学院现有农业部都市农业（北方）重点实验室、农业应用新技术北京市重点实验室、兽医学（中医药）北京市重点实验室、农产品有害微生物及农残安全检测与控制北京市重点实验室、奶牛营养学北京市重点实验室、农业生物制品与种业中关村开放实验室、食品质量与安全北京实验室、北京市乡村景观规划设计工程技术研究中心、北京市农村远程信息服务工程技术研究中心（共建）、北京市中兽药工程技术研究中心（共建）、北京市果树良种繁育工程技术研究中心（共建）、北京市食品安全免疫快速检测工程技术研究中心（共建）、蛋品安全生产与加工北京市工程研究中心（共建）、微生态制剂关键技术开发北京市工程实验室（共建）、北京新农村建设研究基地、首都农产品安全产业技术研究院、北京都市农业研究院、北京市大学科技园等18个省部级科研机构和成果转化基地；有1个农业部现代农业技术培训中心，1个国家级科技特派员创新创业培训基地。

    学校现有园艺学、兽医学、作物学、风景园林学、林学、食品科学与工程、农林经济管理7个一级学科硕士学位授予点，覆盖了21个二级学科硕士学位授予点；有农业推广硕士、兽医硕士、风景园林硕士、工程硕士4个专业学位类别14个招生领域。

    学校现有教职工1200余人，其中专任教师500余人，教授、副教授290人。硕士研究生导师314人，兼职博士生导师15人。教师中受聘为亚美尼亚工程院“外籍院士”1人，享受国务院特殊津贴专家5人，北京市有突出贡献的科学、技术、管理人才1人，北京市高层次人才2人，教育部新世纪优秀人才1人，北京市长城学者4人，北京市级中青年骨干教师65人。

    学校现有各类在校生8000余人，其中研究生在校生1000余人，已形成以本科教育为主、加快发展研究生教育和留学生教育、兼有高等职业技术教育和继续教育的多类型、多层次的都市型高等农业教育体系。