全日制硕士研究生享受研究生国家助学金，标准为每生6000元/学年，国家助学金覆盖面为100%（有固定工资收入的学生除外）。

根据上级主管部门分配的名额，表现特别优异的全日制在校硕士研究生可申请研究生国家奖学金，奖励标准为每生20000元/学年。

学校还为全日制硕士研究生设立“曲阜师范大学研究生学业奖学金”，额度每生每年5000元到8000元，学业奖学金的覆盖面为100%（有固定工资收入的学生除外）：推免生、一志愿报考我校且入学综合成绩（包括初试和复试成绩）位列本专业前20%的学生，第一学年可直接获得硕士一等学业奖学金，奖励标准为8000元；其他一志愿报考我校考生第一学年均可获得硕士二等学业奖学金，奖励标准为6000元；调剂我校考生第一学年可获得硕士三等学业奖学金，奖励标准为5000元。高年级硕士研究生一等学业奖学金覆盖比例40%，奖励金额8000元；二等学业奖学金覆盖比例40%，奖励金额6000元；三等学业奖学金覆盖比例20%，奖励金额5000元。

在校全日制硕士研究生还可申请优秀研究生奖学金、研究生单项奖学金、优秀研究生干部奖学金、优秀毕业研究生奖学金、研究生“圣地英才奖”、“华藏奖学金”以及研究生学位论文科研创新资助基金等。

全日制研究生平均获得的助学金和奖学金总额高于所交学费。

学校设立“三助”岗位，在“三助”岗位工作的在校生学校每月发放400元的津贴；家庭经济困难的在校生，经申请和认定后，学校一次性发放困难补贴；经济困难学生亦可申请生源地信用助学贷款，最高额度不超过12000元/学年。

学校提供专项资金支持研究生参加国内外的学术讨论交流活动。