学校还以应用型、技术型科学研究为导向，从工程实际和技术开发中凝练出科学问题进行应用基础研究。获得国家自然科学基金、国家社会科学基金、部委攻关项目、科技部重大基础前期研究专项等国家项目115项，省部级项目250项。出版学术专著和教材121部，发表学术论文3563 篇，其中核心刊物论文 1899 篇，三大检索收录论文587 篇，申请专利数906项，其中发明专利534项，授权专利471项。学校科研经费从合校之初的300多万元，上升到2013年的1.70亿元。五年来，学校先后与企业签署了786项合作协议，项目经费近2亿元。获省部级以上科研成果奖25项。校长卢冠忠教授的“稀土催化材料及在机动车尾气净化中应用”项目于2009年获国家科技进步二等奖、上海市技术发明一等奖。肖作兵教授主持完成的“高品质香精制备与品质控制关键技术及应用”项目，获2012年度上海市科技进步奖一等奖。学校还承担上海石化焦油综合利用、飞机汽车工业和大电气设备等高性能金属材料研制、宝钢的节能改造项目，积极参与国家战略和上海市重点项目的科技攻关，包括高铁和城市轨交的技术攻关项目等，产生了积极的社会经济效益，提升了教师的科研能力，从而反哺了本科教学，提高了应用型人才的培养质量。2013年，学校荣获上海市科技进步奖二等奖1项，三等奖2项。