西藏藏医学院作为全国乃至全世界唯一独立设置的藏医药高等院校，其教学科研条件得到了长足的发展。目前学院图书馆珍藏有珍贵的《大藏经》及2100多卷传统藏医药典籍与近百幅传统藏医药教学彩色唐卡；实验标本中心收集有藏药材标本2000余种；藏医药天文星算博物馆是全国首家专门展示藏民族优秀传统文化——藏医药和天文星算的博物馆。学院现有1所专家门诊、1家藏药厂、1个采认药基地和2所教学医院、1所非直属附属医院、1个非直属教学药厂。作为全国唯一有权授予藏医硕士学位的高校，经过多年的发展，形成了一批优势和特色学科。目前拥有本专科专业4个（藏医本科、藏药本科、藏医专科、天文星算专科）；1个藏医硕士授予点，1个国家中医药管理局重点学科——藏药（生药）学，1个中央与地方共建高校基础实验室，1个省部共建重点实验室。

西藏藏医学院注重发挥专业优势，致力于藏医药科学研究，科技开发，先后承担并完成了国家级科研项目9项，省部级8项，其中1项成果获藏医药国际学术大会金奖，1项成果获国家科技进步二等奖， 1项成果获国家教学成果二等奖，有近10项科研成果得到转化，部分产品远销海外。目前承担包括“863”项目在内的国家科研项目14项；省部级项目6项。学院专家门诊藏医药专科专病特色突出，诊疗技术水平较高，深受患者欢迎；学院藏药厂2004年通过GMP认证，现生产藏药品种达64种，其中24种药品获得国家批准文号，7个品种被列入国家中药保护品种，3个产品被评为自治区名优产品，2个品种被评为国家技术创新优秀产品，列入“全国重点科技项目计划”和“国家级火炬计划项目”。