学校下设第一临床医学院、第二临床医学院、第三临床医学院/康复医学院、第四临床医学院、第五临床医学院、杭州临床医学院、基础医学院、公共卫生学院、口腔医学院、药学院、护理学院、医学技术与信息工程学院、生命科学学院、人文与管理学院以及继续教育学院、国际教育学院、马克思主义学院、体育部、创新创业学院等，举办1所独立学院（滨江学院）。

https://www.zcmu.edu.cn/kxyj/kypt.htm

https://www.zcmu.edu.cn/kxyj/zdxk.htm

https://yjsgl.zcmu.edu.cn/page/2

https://yjsgl.zcmu.edu.cn/yjsy_graduate/public/admin.php/cms/publicity/teacherList.html

现有全日制在校生22000余人（含独立学院），其中硕博士研究生4700余人、学历留学生800余人。

（以上数据更新至2023年3月）